很可惜 T 。T 您现在还不是作者身份,不能自主发稿哦~
如有投稿需求,请把文章发送到邮箱service@hrtwrk.com,一经录用会有专人和您联系
咨询如何成为春羽作者请联系:悠觅云栈小羽毛
非脱羧勒克菌(Leclercia adcarboxglata)是两个勒克粒耐一种广泛存在于自然界中的肠杆菌科革兰阴性兼性厌氧菌,与大肠杆菌有许多相同的自非R质制研生化特征,能引起免疫功能不全或有慢性疾病患者的脱羧感染,是菌的究多种微生物感染的病原体之一,与其他细菌共同引起较为严重的药机共感染。该菌是两个勒克粒耐一种机会致病菌且与诱发因素有关,如创伤或免疫抑制等,自非R质制研可从血液、脱羧粪便、菌的究痰、药机尿、两个勒克粒耐腹膜液和脓液中分离获得。自非R质制研
β‑内酰胺类抗生素在过去70年被广泛作为抗菌药物,脱羧其耐药现象可由多种机制引起,菌的究如产β‑内酰胺酶、药机主动外排系统、生物被膜机制、膜孔蛋白缺失以及与青霉素结合蛋白亲和力下降等,其中β‑内酰胺酶水解或修饰β‑内酰胺类抗生素使其失活,使相应菌株对几乎所有β‑内酰胺类抗生素产生耐药性,质粒携带β‑内酰胺耐药基因是导致菌株耐药性快速传播的主要原因。非脱羧勒克菌对头孢菌素、碳青霉烯类、四环素类、氨基糖苷类、喹诺酮类和氯霉素敏感,近年来陆续报道了少量产超广谱β‑内酰胺酶(extended‑spectrumβ‑lactamases,ESBL)和碳青霉烯酶的非脱羧勒克菌感染相关病例。现阶段只有少量多药耐药(multi‑drug resistant,MDR)的非脱羧勒克菌被报道,关于blaCTX‑M的报道仅有2例。
本研究中,我们对来源于原南京军区总医院重症急性胰腺炎患者血液样本的菌株150707804和重庆医科大学附属第一医院胃癌患者胃引流样本的菌株P12375进行了分析,旨在对其遗传背景、耐药表型进行鉴定,通过高通量全基因组序列测定分析,结合生物信息学研究,对其携带耐药基因的移动元件和耐药基因座位进行精细注释,揭示非脱羧勒克菌多重耐药的传播机制。
菌株150707804分离自47岁男性重症急性胰腺炎患者血液样本,菌株P12375分离自63岁男性胃癌患者引流液样本。16S rDNA基因扩增初步确定菌种。
使用VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析仪对菌株150707804、P12375分别进行药敏MIC检测,依据美国临床与实验室标准学会(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)2020标准判读结果[20]。
使用Qiagen公司的Ultra Clean®Microbial DNA Isolation kit(CAT.12224‑250)试剂盒,分别从分离株150707804和P12375中提取基因组DNA。构建均值约15 kb(10~20 kb)的DNA文库,通过PacBio RSII测序平台进行“三代”高通量基因组测序。同时,构建均值约400 bp(150~600 bp)的双端测序(paired‑end)文库,利用HiSeq“二代”测序平台上机测序。通过Proovread[21]软件用短双端测序读长(paired‑end reads)校正PacBio长reads,校正过的PacBio reads通过HGAP v3.0(基因组覆盖率100×)进行拼接组装,最终获得野生株完整基因组全序。
以复制子repA正向序列起始密码子的第一个碱基作为整个质粒的“+1”位点,首先采用RAST 2.0初步预测质粒的开放阅读框(open reading frame,ORF),结合BLASTP/BLASTN、RefSeq数据库和Conserved Domains数据库进行ORF和假基因的逐个功能分析。利用在线数据库ResFinder和CARD对耐药基因进行注释,ISfinder、INTEGRALL和Tn Number Registry分别对插入序列、整合子、转座子等结构进行注释。用Inkscape 1.0绘制质粒整体结构图、质粒近源结构比较图和耐药基因座位精细结构比较图。
两株菌进行全基因组测序后,得到质粒p707804‑CTXM和pP12375‑CTXM序列,提交至Gen‑Bank,登录号分别为MN823992和MN821366。
菌株150707804和P12375经16S rDNA扩增初步鉴定,全基因组DNA序列与非脱羧勒克菌USDA‑ARS‑USMARC‑60222(登录号:NZ_CP013990)进行平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)比对,结果菌株150707804为98.66%、菌株P12375为98.72%,最终核定两株菌均为非脱羧勒克菌。
野生株150707804对青霉素类、头孢菌素类、碳青霉烯类、喹诺酮类、单环β‑内酰胺类及呋喃类抗生素耐药,对氨基糖苷类和磺胺类抗生素敏感;野生株P12375对青霉素类、头孢菌素类、碳青霉烯类、单环β‑内酰胺类及呋喃类抗生素耐药,对氨基糖苷类、喹诺酮和磺胺类抗生素敏感(表1),其中,喹诺酮类和呋喃类耐药表型不同,可能原因:(1)喹诺酮类抗生素的主要作用靶点为DNA螺旋酶和拓扑异构酶Ⅳ,使细菌DNA不能形成超螺旋。质粒p707804‑CTXM和pP12375‑CTXM无喹诺酮类耐药基因,其对应染色体上也不含有耐药基因,但菌株150707804和P12375的其他质粒中分别含有qnrA、aac(6′)Ib-cr和qnrS、aac(6')Ib-cr。P12375对喹诺酮类抗生素敏感可能是由于耐药基因突变不表达所致;(2)呋喃类抗生素主要由对氧不敏感的硝基还原酶基因(nfsA和nfsB)突变失活引起,干扰氧化还原酶从而阻断细菌的正常糖代谢。质粒p707804‑CTXM和pP12375‑CTXM不含呋喃类耐药基因,且菌株150707804和P12375的其他质粒及染色体上也不含该类耐药基因,可能是由于外排泵等其他耐药机制引起表型差异,并不属于本研究的范围。
2.3.1质粒p707804‑CTXM和pP12375‑CTXM的基本特征
p707804‑CTXM和pP12375‑CTXM大小分别为110.2和116.7 kb(图1,表2)。两个质粒全序高度相似(覆盖度75%、核苷酸同源性98.69%),均包含保守骨架区(覆盖度85%、核苷酸同源性98.69%)和外源插入区。
质粒p707804‑CTXM和pP12375‑CTXM骨架区总长度分别为84.3和85.8 kb(图2)。二者均由质粒复制相关区(plasmid replication)、质粒稳定相关区(plasmid maintenance)以及质粒接合转移相关区(conjugal transfer)组成。两个质粒有一定保守性,它们含有相同的复制子repA,为同一类型质粒;含相同的质粒稳定相关基因parA、stbAB等;接合转移区均含tra和pil两个基因簇。同时,这两个质粒也存在差异性:(1)pP12375‑CTXM中orf531被MDR区分割为两部分,而在p707804‑CTXM中orf531完整;(2)两质粒orf531至parA间差异性较大,有大片段的序列置换;(3)p707804‑CTXM的orf516与pP12375‑CTXM的orf927存在基因置换;(4)接合转移区内p707804‑CTXM的orf774、orf234与pP12375‑CTXM的orf1890存在基因置换。
声明:本文所用图片、文字来源《师范大学学报》,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系删除。
相关链接:青霉素,碳青霉烯,氨基糖苷
本文为作者独立观点,不代表悠觅云栈立场,未经允许不得转载。
我们致力于提供一个高质量内容的交流平台。为落实国家互联网信息办公室“依法管网、依法办网、依法上网”的要求,为完善跟帖评论自律管理,为了保护用户创造的内容、维护开放、真实、专业的平台氛围,我们团队将依据本公约中的条款对注册用户和发布在本平台的内容进行管理。平台鼓励用户创作、发布优质内容,同时也将采取必要措施管理违法、侵权或有其他不良影响的网络信息。
一、根据《网络信息内容生态治理规定》《中华人民共和国未成年人保护法》等法律法规,对以下违法、不良信息或存在危害的行为进行处理。
1. 违反法律法规的信息,主要表现为:
1)反对宪法所确定的基本原则;
2)危害国家安全,泄露国家秘密,颠覆国家政权,破坏国家统一,损害国家荣誉和利益;
3)侮辱、滥用英烈形象,歪曲、丑化、亵渎、否定英雄烈士事迹和精神,以侮辱、诽谤或者其他方式侵害英雄烈士的姓名、肖像、名誉、荣誉;
4)宣扬恐怖主义、极端主义或者煽动实施恐怖活动、极端主义活动;
5)煽动民族仇恨、民族歧视,破坏民族团结;
6)破坏国家宗教政策,宣扬邪教和封建迷信;
7)散布谣言,扰乱社会秩序,破坏社会稳定;
8)宣扬淫秽、色情、赌博、暴力、凶杀、恐怖或者教唆犯罪;
9)煽动非法集会、结社、游行、示威、聚众扰乱社会秩序;
10)侮辱或者诽谤他人,侵害他人名誉、隐私和其他合法权益;
11)通过网络以文字、图片、音视频等形式,对未成年人实施侮辱、诽谤、威胁或者恶意损害未成年人形象进行网络欺凌的;
12)危害未成年人身心健康的;
13)含有法律、行政法规禁止的其他内容;
2. 不友善:不尊重用户及其所贡献内容的信息或行为。主要表现为:
1)轻蔑:贬低、轻视他人及其劳动成果;
2)诽谤:捏造、散布虚假事实,损害他人名誉;
3)嘲讽:以比喻、夸张、侮辱性的手法对他人或其行为进行揭露或描述,以此来激怒他人;
4)挑衅:以不友好的方式激怒他人,意图使对方对自己的言论作出回应,蓄意制造事端;
5)羞辱:贬低他人的能力、行为、生理或身份特征,让对方难堪;
6)谩骂:以不文明的语言对他人进行负面评价;
7)歧视:煽动人群歧视、地域歧视等,针对他人的民族、种族、宗教、性取向、性别、年龄、地域、生理特征等身份或者归类的攻击;
8)威胁:许诺以不良的后果来迫使他人服从自己的意志;
3. 发布垃圾广告信息:以推广曝光为目的,发布影响用户体验、扰乱本网站秩序的内容,或进行相关行为。主要表现为:
1)多次发布包含售卖产品、提供服务、宣传推广内容的垃圾广告。包括但不限于以下几种形式:
2)单个帐号多次发布包含垃圾广告的内容;
3)多个广告帐号互相配合发布、传播包含垃圾广告的内容;
4)多次发布包含欺骗性外链的内容,如未注明的淘宝客链接、跳转网站等,诱骗用户点击链接
5)发布大量包含推广链接、产品、品牌等内容获取搜索引擎中的不正当曝光;
6)购买或出售帐号之间虚假地互动,发布干扰网站秩序的推广内容及相关交易。
7)发布包含欺骗性的恶意营销内容,如通过伪造经历、冒充他人等方式进行恶意营销;
8)使用特殊符号、图片等方式规避垃圾广告内容审核的广告内容。
4. 色情低俗信息,主要表现为:
1)包含自己或他人性经验的细节描述或露骨的感受描述;
2)涉及色情段子、两性笑话的低俗内容;
3)配图、头图中包含庸俗或挑逗性图片的内容;
4)带有性暗示、性挑逗等易使人产生性联想;
5)展现血腥、惊悚、残忍等致人身心不适;
6)炒作绯闻、丑闻、劣迹等;
7)宣扬低俗、庸俗、媚俗内容。
5. 不实信息,主要表现为:
1)可能存在事实性错误或者造谣等内容;
2)存在事实夸大、伪造虚假经历等误导他人的内容;
3)伪造身份、冒充他人,通过头像、用户名等个人信息暗示自己具有特定身份,或与特定机构或个人存在关联。
6. 传播封建迷信,主要表现为:
1)找人算命、测字、占卜、解梦、化解厄运、使用迷信方式治病;
2)求推荐算命看相大师;
3)针对具体风水等问题进行求助或咨询;
4)问自己或他人的八字、六爻、星盘、手相、面相、五行缺失,包括通过占卜方法问婚姻、前程、运势,东西宠物丢了能不能找回、取名改名等;
7. 文章标题党,主要表现为:
1)以各种夸张、猎奇、不合常理的表现手法等行为来诱导用户;
2)内容与标题之间存在严重不实或者原意扭曲;
3)使用夸张标题,内容与标题严重不符的。
8.「饭圈」乱象行为,主要表现为:
1)诱导未成年人应援集资、高额消费、投票打榜
2)粉丝互撕谩骂、拉踩引战、造谣攻击、人肉搜索、侵犯隐私
3)鼓动「饭圈」粉丝攀比炫富、奢靡享乐等行为
4)以号召粉丝、雇用网络水军、「养号」形式刷量控评等行为
5)通过「蹭热点」、制造话题等形式干扰舆论,影响传播秩序
9. 其他危害行为或内容,主要表现为:
1)可能引发未成年人模仿不安全行为和违反社会公德行为、诱导未成年人不良嗜好影响未成年人身心健康的;
2)不当评述自然灾害、重大事故等灾难的;
3)美化、粉饰侵略战争行为的;
4)法律、行政法规禁止,或可能对网络生态造成不良影响的其他内容。
二、违规处罚
本网站通过主动发现和接受用户举报两种方式收集违规行为信息。所有有意的降低内容质量、伤害平台氛围及欺凌未成年人或危害未成年人身心健康的行为都是不能容忍的。
当一个用户发布违规内容时,本网站将依据相关用户违规情节严重程度,对帐号进行禁言 1 天、7 天、15 天直至永久禁言或封停账号的处罚。当涉及欺凌未成年人、危害未成年人身心健康、通过作弊手段注册、使用帐号,或者滥用多个帐号发布违规内容时,本网站将加重处罚。
三、申诉
随着平台管理经验的不断丰富,本网站出于维护本网站氛围和秩序的目的,将不断完善本公约。
如果本网站用户对本网站基于本公约规定做出的处理有异议,可以通过「建议反馈」功能向本网站进行反馈。
(规则的最终解释权归属本网站所有)
Powered by © 2010-2022 悠觅云栈 辽ICP备97645398号